Curso de Informática Data Management e programação para a medicina genômica, teórico e prático será totalmente online, dividido por módulos de Introdução ao Linux, programação Sed/AWK, VCF Tools, Python/Pandas. Professores experientes e presença de monitores que atuam na área de Medicina Genômica.

Público-alvo: Profissionais das áreas biológicas e biomédicas ( biólogo, biomédico, médico, farmacêutico, etc) , exatas que atuam na área da genômica humana, médica e bioinformática.

Vagas: 25 vagas (1 monitor a cada 5 alunos).

Data e horário: As aulas acontecerão entre as 17 horas e 19 horas, às segundas, terças e quintas (exceto feriado). Com início dia 18 de Maio e término dia 29 Junho de 2021. A carga horária total varia de acordo com o número de módulos que irá fazer.

Programação:

> Módulo Introdutório - Arquitetura de computadores e  LINUX (4 horas - 1° semana): No módulo de Arquitetura de computadores e  LINUX nós estudaremos os principais componentes de um computador, além de elucidar o processo de tomada de decisões associadas a esses componentes. Uma vez concluído este módulo, apresentaremos o Sistema Operacional LINUX, apresentando os comandos mais comuns e realizando uma atividade prática em um servidor remoto.

> Módulo 1 -  SED/AWK E VCFTools (12 horas - 2° semana a 4° semana): Nossa proposta com o módulo SED/AWK E VCFTools  é qualificar o profissional com um perfil mais voltado para ciências biológicas a manipular e editar tabelas e arquivos de dados genéticos de forma simples e direta através do SED and AWK. Apresentaremos os principais formatos de arquivos de dados genéticos utilizados atualmente (.fasta, .fastq, .sam, .bam, .gtf, .ped/map, .vcf) e bancos de dados de anotação genômica clínica (ClinVar e ANNOVAR). Nosso curso também abordará a gestão de arquivos VCF através da ferramenta VCFTools. No nosso módulo realizamos atividades práticas através da resolução de exercícios em um servidor remoto com auxílio de monitores qualificados atuantes na área de Medicina Genômica.

> Módulo 2 -  Python (20 horas - 4° semana a 7° semana): No curso de Programação em Python podemos dividir nosso curso em duas etapas: Introdução a Algoritmos, no qual estudaremos a forma de criar algoritmos através de uma Pseudo-linguagem de programação. Após isso teremos a introdução a Python, no qual converteremos os comandos aprendidos em Pseudo-linguagem para Python, além de utilizar bibliotecas como PANDAS, uma das principais bibliotecas utilizadas para Data Science, e PyVCF, uma biblioteca em Python para manipulação de arquivos VCF.

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