Introdução a Bioinformática (Bioinfo 101): Curso Inteiro

Introdução a Bioinformática (Bioinfo 101)

Estamos entusiasmados em apresentar a você o Curso de Introdução à Bioinformática (Bioinfo 101), parte do calendário de cursos ofertados em 2024 pela RSG-Brazil. Este curso é uma oportunidade imperdível para explorar os fundamentos emocionantes da bioinformática e suas aplicações na ciência moderna.

Nível:

Introdução 

Tipo:

Teórico

Ministrante:

1° Bernardo Velozo - (M.Sc Candidate) - Profissional com formação em Ciências Biológicas com foco em licenciatura (UNIGRANRIO - 2021) e atualmente cursando Mestrado em Bioquímica (UFRJ). Foi aluno de iniciação cientifica por dois anos no laboratório de bioinformática (Bioinfo) da UFRJ como bolsista PIBIC-CNPq no projeto "Desenvolvimento de software com inteligência artificial para antecipação de mutações funcionais em proteínas alvo de antibióticos". Mestrando no Programa de Pós-Graduação em Bioquímica (PPGBq) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro, vinculado Laboratório de Bioinformática (Bioinfo) no projeto "Genomas da ordem Saccharomycetales com potencial biotecnológico Identificação de hidrolases"

2° Bibiana Fam - Ph.D, MSc.Bibiana Fam , Bióloga (UFRGS - 2015), possui Mestrado (UFRGS- 2018) e Doutorado (UFRGS- 2022) em Genética e Biologia Molecular, Pós-Doutorado em Imunogenética e Epidemiologia (UFRGS - 2023). Atualmente é pesquisadora do Hospital de Clínicas de Porto Alegre, Centro de Pesquisa Experimental- Laboratório de Medicina Genômica, e pesquisadora Pós-doc FFMUSP/MS junto ao Projeto DNA do Brasil. Possui experiência em evolução molecular, genômica comparativa, genética médica/populacional, e implementação de pipelines na análise de dados de NGS.

3° Nilson Coimbra - (Ph.D, MSc. Bioinformatics, Eng ) - Engenheiro da Computação (Estácio de Sa - 2013), Mestre em Bioinformática (UFPR- 2015), e Doutor em Bioinformática (UFMG - 2019) com período sanduiche no Departamento de Ciência da Computação na Universidade de Sherbrooke (Quebec - Canada). Possui ampla experiencia em analise de dados NGS, genômica comparativa, reconstrução de genoma ancestral e desenvolvimento de IA aplicada aos dados genômicos. É membro ativo do Edu COSI da ISCB e Next-Gen Leader em Educação e Treinamento em Bioinformática. Atualmente é Pós-doutorado da Faculdade de Medicina da USP, atuando principalmente em Metagenômica aplicada à Clinica Médica, e também na criação de dashboard para caracterização e vigilância genômica de organismos resistentes à antibióticos.

4° Vicente Salgado Pires - (Ph.D Candidate) - Profissional com formação em Biomedicina (UNIRIO - 2017) e Mestrado em Biologia Molecular e Celular (UNIRIO - 2020) atualmente cursando Doutorado em Bioquímica (UFRJ). Possui ampla experiência em biologia computacional e estrutural com ênfase em modelagem molecular de proteínas e simulação de dinâmica molecular. Atualmente trabalha com análise computacional de protótipos a fármacos para tratamento da leishmaniose.

Calendário previsto:

Aula 1 - Conceitos básicos de computadores e de biologia molecular. 

Professor Bernardo Saraiva Velozo

Aula dia 10/05 das 9h às 12h

Conteúdo:

Bloco 1; hardware, sistema operacional e programas

Bloco 2: Estrutura do DNA, tradução, frames de leitura, estrutura de proteínas e domínios conservados

Aula 2 - Bases de banco de dados.

Professor Bernardo Saraiva Velozo

Aula dia 10/05 das 14h até às 17h

Conteúdo:

Bloco 1: O que são bancos de dados? Lógica Booleana.

Bloco 2: Genbank, Uniprot e outros bancos de dados.

Aula 3 - Alinhamento de sequências e BLAST.

Professor Bernardo Saraiva Velozo

Aula dia 17/05 das 9h até às 12h

Conteúdo:

Bloco 1: O que é similaridade? Funcionamento do BLAST.

Bloco 2: Matrizes de Valor e Uso do BLAST.

Aula 4 - Sequenciamento de genoma e transcriptoma

Professor Bibiana Fam

Aula dia 17/05 das 14h até as 17h

Conteúdo:

Bloco 1:  O que é sequenciamento?, conceitos básicos, tipos de genômica e história de análise do DNA.

Bloco 2: Tecnologias de sequenciamento e análises de bioinformática.

Bloco 3: Ciências Ômicas e o que é Transcriptômica?

Bloco 4: Etapas da análise de transcriptoma (workflow) e análise de resultados.

Aula 5 - Genômica Comparativa e Big Data - Ortologia, paralogia, homologia, similaridade e reconstrução filogenética

Professor Nilson Coimbra

Aula dia 24/05 das 9h até às 12h

Conteúdo:

Bloco 1: Identidade, Similaridade, função, Processo evolutivo e tipos de evolução.

Bloco 2: Homologia, paralogia e ortologia.

Bloco 3: O que é filogenia? Cladística, Clados, Tipos de características.

Bloco 4: Filogenia molecular, relógio molecular e análises filogenéticas.

Aula 6  - Bioinformática Estrutural 

Professor Vicente Salgado Pires

Aula dia 24/05 das 14h até as 17h

Conteúdo:

Bloco 1: Conceitos de bioquímica, Estrutura e conformação, Porque modelar?

Bloco 2: Modelagem comparativa, Modelagem ab-initio, Modelagem por IA.